Material zur Vorlesung „Modelle Zellulärer Prozesse“

Das Skript zum ersten Teil der Vorlesung ist handschriftlich und daher von nicht besonderer Qualität, sorry.

Das Skript zum zweiten Teil der Vorlesung ist umfangreicher als das Material, das tatsächlich behandelt wurde. In der Klausur kommt potentiell natürlich nur das dran, was auch behandelt wurde.

Die Artikelsammlung ist unvollständig und deckt nur bestimmte Bereiche der Vorlesung ab. Am Ende jedes Teiles im Skript ist eine weiterführende Liste.

Skripte

  • Exzerpt für die Vorlesung „Einführung in die Systembiologie“ für die Biosystemtechniker der OvGU <pdf>
  • Skript für den ersten Teil der Vorlesung (Modellierung/Stochastische Prozesse/Bausteine) <pdf>
  • Skript für den zweiten Teil der Vorlesung (Parameterschaetzung) (in englisch) <pdf>
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    Literatur für den ersten Teil der Vorlesung

  • Modellierung allgemein: Klipp E., Schaber J.(2006) Modeling of Signal Transduction in Yeast – Sensitivity and Model Analysis. <pdf>
  • Stochastische Prozesse: Gillespie (1976) J. Comp. Phy. 22 <pdf>
  • Stochastische Prozesse: Gillespie (1992) Physica 188 <pdf>
  • Monotone Systeme: Angeli et al. (2004) PNAS 101 <pdf>
  • Bausteine zellulärer Prozesse: Tyson et al. (2003) Curr. Opinion Cell Biol. 15 <pdf>
  • Enzymatische Oszillationen: Queeney et al (1996) Chemical Education 1 <pdf>
  • Ultrasensitivität: Ferrell (1996) Trends Biochem. Science 21 <pdf>
  • Negativer Feedback auf ein Gen: Griffith (1968) Theor. Biol. 20 <pdf>
  • Bausteine in Praxis: Gardener et al. (2000) Nature 403 <pdf>
  • Bausteine in Praxis: Elowitz & Leibler (2000) Nature 403 <pdf>